为进一步完善贵阳孔学堂的功能定位，提升贵阳孔学堂学术研究的水平，充分发挥贵阳孔学堂的学术研修作用，省市领导要求在贵阳孔学堂成立“高等研究院”，建立一支贵阳孔学堂自己的研究队伍。

　　在省市主要领导的大力支持下，在市委组织部及省、市编委办的全力帮助下，2016年9月，“贵阳孔学堂高等研究院”获批建立，与“阳明心学与当代社会心态研究院”采取“一个内设机构、两块牌子”的管理形式。贵阳孔学堂高等研究院主要职责是汇聚高端学术资源，以中华传统文化为主要领域，组织实施专业化、系统化研究，推进中华传统文化的创造性和创新性发展，为国家、贵州省、贵阳市宣传文化建设提供服务。